龙眼港作为国家一类开放口岸,现已进驻了海关、边防检查站、海事局、出入境检验检疫局等国家查验机构,代表国家行使主权,为进出龙眼港的船舶、货物及旅客办理出入境手续,在国际贸易、进出口业务等方面为境内外企业提供便捷、高效、优质的服务。
中华人民共和国石岛海关驻龙眼港办事处负责监管进出境的运输工具、货物、行李物品、邮递物品和其他物品;征收关税和其他税、费;查缉走私;编制海关统计;办理其他海关业务等。
中华人民共和国石岛出入境检验检疫局驻龙眼港办事处代表国家行使主权,主要负责出入龙眼港的卫生检疫、动植物检疫和商品检验 。
中华人民共和国威海龙眼海事处对龙眼港海事业务进行专业研究、指导、监督和管理,具体承担船舶监督、危险品和防污染管理、船员管理、通航管理、航运公司安全管理体系审核管理等海事监管业务。
中华人民共和国龙眼边防检查站是保卫国家的主权和安全, 对出入国境的人员等进行的检查而设立的国家机构。负责对出入国境人员的护照、证件、签证、出入境登记卡、出入境人员携带的行李物品和财物、交通运输工具及其运载的货物等的检查和监护, 以及对出入国境上下交通运输工具的人员的管理和违反规章行为的处理等。